La PCi repose généralement sur une structure régionale (les 5 anciens district du Jura bernois). Cette dernière est composée de contingents de personnels répartis dans cinq domaines d'activités :
Chaque domaine d’activité fonctionne selon ses compétences respectives mais toujours en étroite collaboration avec les autres ainsi qu'avec les partenaires de la protection de la population. L'objectif principal est la maîtrise en commun des catastrophes et des situations d'urgence.